보통 면역검사라고 하는 것은 HIV 표적세포 (HIV가 감염되는 세포)이자 면역기능에 중추적 역할을 담당하는 CD4 양성 T 림프구 수를 측정하는 것을 말하며 질병진전 상태를 판단하는 기본 자료로 활용된다. 이러한 검사를 위해 유세포 분석기가 사용되고 있다.