질병관리청에서는 혈중 HIV-RNA 바이러스 농도 검사를 실시하는데 Thermal Cycler라는 장비로 혈액에 존재하는 HIV의 유전자 (RNA)를 중합효소 연쇄반응 (Polymerase chain reaction)에 의해 증폭하여 양을 측정한다. 중합효소 연쇄반응 기계를 사용하여 검사를 하면 HIV-RNA 20 copies/mL 까지 검출할 수 있을 정도로 예민도가 좋지만 측정방법이나 숙련도 등에 따라 실제보다 3배 정도까지 차이가 날 수 있으므로 같은 환자에게는 매 검체마다 동일한 방법을 사용하여야 한다. 혈중 HIV-RNA 바이러스 농도 검사는 질병관리청 외에 병원, 외부 검사 기관에서도 시행되고 있다.

혈중 HIV-RNA 바이러스 농도 검사는 HIV 감염 초기의 진단, 항레트로바이러스 치료제 투약 시기 결정, 항레트로바이러스 치료제 투여 전후의 치료 효과 평가, 질병진전 예후 인자의 목적으로 의의가 있어서 대부분의 감염인에서 3 개월 또는 6개월 마다 검사를 시행하고 있다.